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南方农村报

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我国破译南美白对虾基因组

来源:南方农村报时间:2019年01月26日版次:12
  “尽管国际上竞争很激烈,但我们是第一个成功破译凡纳滨对虾基因组,我们感到相当幸运和高兴。”对于中国成功破译并得到了世界上首个高质量的对虾基因组参考图谱,中国科学院海洋研究所研究员相建海喜悦之情难以言表。
  据悉,由中国科学院海洋研究所研究员相建海和李富花课题研究组主导,与国内外多家单位共同合作,历时十年成功破译了凡纳滨对虾基因组,获得了世界上首个高质量的对虾基因组参考图谱,1月21日研究成果在Nature子刊《Nature communications》在线发表,为甲壳动物研究及对虾基因组育种和分子改良提供了重要理论支撑。
  凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)作为四大养殖虾类之首,其年产量达416万吨,具有非常重要的经济价值。然而,由于种质资源匮乏,我国对虾养殖单位每年需从国外引进大量亲虾。受限于没有良好的参考基因组,我国自主的对虾分子遗传育种工作进展一直相对缓慢。
  对虾基因组是世界上公认的高复杂基因组,阻碍了多个国际科研机构的研究步伐。在该研究中,通过分析发现,以1-6碱基为单位多次重复的简单串联序列(SSR)占对虾基因组的23.93%以上,是目前已测基因组物种中含量最高的,这也是对虾基因组高复杂性的根本原因,并推测SSR的暴发与对虾祖先适应性进化过程有关。
  对虾基因组的发表为甲壳动物底栖适应和蜕皮等研究提供了重要的理论基础和数据支撑,同时也为对虾基因组育种和分子改良工作提供了重要的基础平台。“基因组的破译能够让我们对虾类有更多认知上的可能性。通过深入挖掘,转化为成有利于产业发展的技术。”相建海告诉南方农村报记者,由于甲壳动物在生物进化中跟昆虫类似,破译了对虾的基因图谱,对生物之间的特征,进化中适应性的进化机制有重要的意义。
  南美白对虾基因组破译也使得本土选育可以从传统家系选育朝着基因编辑,分子育种等先进选育方式向前迈进一大步,具有划时代的意义。 □彭日立
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